Karlsen (født 1974) tiltrådte som fylkesmann 2. januar 2019. Fra 1. januar 2021 ble jobbtittelen endret til statsforvalter.
Han kom fra stillingen som overlege ved akuttmedisinsk klinikk på Nordlandssykehuset i Bodø.
I årene 2014 til 2017 var Karlsen statssekretær i Samferdselsdepartementet. Han har også vært varaordfører i Bodø kommune i tre år. Han har tidligere hatt flere verv i Fremskrittspartiet.
Karlsen ble i juni 2025 oppnevnt til medlem av politirolleutvalget. Utvalget skal bidra til å definere og tydeliggjøre politirollen. Utvalget skal levere sin utredning innen 15. februar 2027.
Han har i tillegg ledet generalistkommuneutvalget. Utvalget leverte sin utredning til Kommunal- og distriktsdepartementet 29. mars 2023.
I 2024 ble Karlsen utnevnt til sin andre av to mulige åremålsperioder som statsforvalter. Åremålet er for perioden 1. januar 2025 til 31. desember 2030.
Biervervene er godkjent av departement.
- Nestleder i FK Bodø/Glimts styre.
- Petroleums- og dykkerlege i eget enkeltmannsforetak. Utfører primært årlig helseundersøkelse av yrkesdykkere.
- Politirolleutvalget (utvalgsmedlem).